Fu stimato prodigio che il medesimo giorno della pace il Tevere inondò sí fattamente, che allagò tutto 'l piano di Roma e destrusse gran parte delle fortificazioni fatte al Castel Sant'Angelo. Il duca d'Alva andò personalmente a Roma a sottomettersi al pontefice e ricever l'assoluzione per nome del re e proprio; e successe che il vittorioso ebbe a portar l'indegnità et il vinto a trionfare maggiormente che se vittorioso fosse stato; e non fu poca grazia che dal papa umanamente fosse raccolto, se ben con la solita grandezza fastosa.
     
     
      [Movimenti per la religione in Francia]
     
      Non ben tosto la guerra fu finita, che nuovi travagli vennero al pontefice, perché di Francia fu avisato che la notte de' 5 settembre in Parigi s'erano ridotti a celebrar la cena in una casa da 200 persone; il che scopertosi dalla plebe, la casa fu assalita, et essendone alquanti fuggiti, le donne et i piú deboli furono presi, de' quali essendone stati 7 abbruggiati, et il maggior numero riservato per l'istesso supplicio, dopo che fossero ben indagati tutti i complici, i svizzeri mandarono ad interceder per gli altri, et il re, che per la guerra col re di Spagna (cosí si chiamò Filippo dopo la renoncia fatta dal padre) aveva di loro bisogno, ordinò che si procedesse con moderazione. Il papa di questo s'alterò fuor di modo, ne fece querimonia in concistoro, disse non esser maraviglia se le cose di quel re succedevano male, perché stimava piú gl'aiuti degl'eretici, che il favor divino. Si era già scordato il pontefice che durante la guerra sua, dolendosi i cardinali dell'Inquisizione che li grisoni protestanti, condotti al suo soldo per la difesa di Roma, usassero molti vilipendii contra le chiese e le imagini, la Santità Sua gli riprese dicendo che quelli erano angeli mandati da Dio per custodia di quella città e sua, e teneva ferma speranza che Dio gl'averebbe convertiti: cosí gl'uomini giudicano diversamente negl'interessi proprii e ne' fatti altrui.