Aldobrandino, che l'haveva ricevuta da Papa Clemente irrevocabilmente per tutta la sua vita; levò quella di Bologna a Montalto, che l'haveva tenuta 18. anni, e creò in Ferrara Legato, Spinola; in Romagna, Gaetano, & in Bologna, il Cardinale Giustignano, tenendoli per poco ben affetti al dominio di Venetia: fece rappezzare, mà con leggierissimi ripari le Città di marina; fece levar li argenti della casa di Loreto, sotto pretesto di assicurarsi: mandò a Ferrara Lucio Savelli, per governar le genti da guerra in quella Città; alli Cittadini della quale furono levate tutte le armi, & voltata l'artiglieria del castello verso la Città, & banditi da quella i forestieri, che non havevano arte o negotio di considerazione; accrebbe le genti d'arme in quella Città, fino al numero di 1800. fanti & 100. cavalli; mutandosi le guardie della cittadella ogni 10. giorni per la diffidenza; & mancando d'armi, fece pigliar quelle della Meldola, che Papa Clemente con un suo breve haveva donato al zio Gio. Francesco Aldobrandino: in Romagna ancora, fece nuovo bando, che tutti li forestieri dovessero partire, & li nativi ritornare. Provide in Ravenna 200. fanti in Cervia 300. in Ancona 40. perche quella Città si guardava da se stessa: fece presidiare le terre di marina con le genti delle sue cernide, gia rassegnate, le guardie delle quali bisognava spesso mutare, & rimettere, per non esse pagate, & perche molti fuggivano.
      Il numero de' soldati, hora era accresciuto, hora era diminuito, secondo che fuggivano, ò erano necessitati à ritirarsi alle loro case; per non haver da sostentarsi: mà certa cosa è, che il numero de' fanti pagati non arrivò mai a 2400. & il numero di Cavalli a 350. mandò in Ancona il Colonel Federigo Fabio Ghisleri eletto Capitano de' cavalli leggieri; il quale anco fece un rolo di 1700. archibugeri a cavallo, descritti in diverse Città dello Stato Ecclesiastico, la maggior parte però senza arme, & senza cavalli, a' quali non diede altro stipendio, che facoltà di portar armi ne però questi mai si ridussero insieme: Fece anco il Pont. una lista di Capitani per servirsene a tempo; la lista de quali fece andar attorno per tutto, & fece chiamar' alquanti di quelli che erano in Fiandra; Prohibì ancora alle terre di Romagna & Marca, il commercio con' Venetiani: quale nondimeno fù quasi subito restituito, provandosi con l'esperienza, esser' di gravissimo danno à loro stessi, il levarlo, massime perche li Gabellieri protestarono di rinonciare le Gabelle; & non si sapeva dove cavar denari altrove, per pagar la soldatesca; Fù prohibito ancora l'estrattione de' danari da 10 scudi in sù, & sequestrate le entrate de' sudditi Venetiani: & in Roma per proveder danari, fù messa nuova impositione sopra il sale, la carne, & la carta; con risolutione di metterne anco sopra il vino, & legname di lavoro, quando il bisogno fosse urgente.